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Mountain Lion でも可能ということだったので、試してみました。
(↓通常のDock)

ターミナル.app などで、以下のコマンドを実行します。
defaults write com.apple.dock hide-mirror -bool true;killall Dock
これで、Dockの背景の板?みたいなヤツが半透明になります。
(↓半透明の背景のDock)

後ろに隠れたウインドウ上の文字などが見えるようになるので、こっちの方が便利。
元に戻すには以下のコマンドを実行します。
defaults write com.apple.dock hide-mirror -bool false;killall Dock